عملیات ساخت فرودگاه شهر طبس از سال ۱۳۶۸ شروع شد و در سال ۱۳۷۲ افتتاح شد. البته پروازهای فرودگاه دو سال پس از افتتاح رسمی و در سال ۱۳۷۴ برقرار شدند. فرودگاه طبس از ابتدای تاسیس زیرنظر اداره فرودگاه های استان خراسان قرار داشت. تا اینکه پس از تغییر در تقسمات کشوری، از ابتدای سال ۱۳۸۱ به اداره کل فرودگاه های استان یزد منتقل شد. البته در خاتمه فروردین سال ۱۳۹۲ با انتزاع از شهرستان طبس از استان یزد و الحاق این شهرستان به استان خراسان جنوبی، فرودگاه طبس در زیرمجموعه فرودگاه های استان خراسان جنوبی نهاده شد.
این فرودگاه امکان پذیرش چهار فروند هواپیمای بدنه میانه و کوچک به طور همزمان را دارد. از لحاظ تعداد و تنوع دستگاه ها و سیستم های هوانوردی و نقش آفرینی در راهنمایی پرواز های عبوری یکی از مهم ترین فرودگاه های جنوب شرق کشور محسوب می گردد. فرودگاه طبس در تقسیم بندی فرودگاه های کشور به عنوان فرودگاهی کشوری، برای انجام پروازهای تجاری در نظر گرفته شده است. بعلاوه، جهت انجام پروازهای آموزشی و در موارد نظامی نیز مورد استفاده سپاه و نیروی انتظامی قرار می گیرد.
